//===============================================================================================================================================================================================================200
//	INCLUDE/DEFINE
//===============================================================================================================================================================================================================200

#include <stdio.h>										// needed by types/functions related to file handling

//===============================================================================================================================================================================================================200
//	READ PARAMETERS FUNCTION
//===============================================================================================================================================================================================================200

#include "./../../main.h"								// needed for definition of fp

//===============================================================================================================================================================================================================200
//	INCLUDE HEADER
//===============================================================================================================================================================================================================200

#include "./file.h"

//===============================================================================================================================================================================================================200
//	READ PARAMETERS FUNCTION
//===============================================================================================================================================================================================================200

void 
read_parameters(char* filename,
				int* tSize,
				int* sSize,
				int* maxMove,
				fp* alpha){

	//================================================================================80
	//	VARIABLES
	//================================================================================80

	FILE* fid;

	//================================================================================80
	//	OPEN FILE FOR READING
	//================================================================================80

	fid = fopen(filename, "r");
	if( fid == NULL ){
		printf( "The file was not opened for reading\n" );
		return;
	}

	//================================================================================80
	//	READ VALUES FROM THE FILE
	//================================================================================80

	fscanf(fid, "%d", &tSize[0]);
	fscanf(fid, "%d", &sSize[0]);
	fscanf(fid, "%d", &maxMove[0]);
	fscanf(fid, "%f", &alpha[0]);

	//================================================================================80
	//	CLOSE FILE
	//================================================================================80

	fclose(fid);

}

//===============================================================================================================================================================================================================200
//	READ HEADER FUNCTION
//===============================================================================================================================================================================================================200

void 
read_header(char* filename,
			int* size,
			int* size_2){

	//================================================================================80
	//	VARIABLES
	//================================================================================80

	FILE* fid;
	int i;
	char c;

	//================================================================================80
	//	OPEN FILE FOR READING
	//================================================================================80

	fid = fopen(filename, "r");
	if( fid == NULL ){
		printf( "The file was not opened for reading\n" );
		return;
	}

	//================================================================================80
	//	SKIP LINES
	//================================================================================80

	i = 0;
	while(i<1){
		c = fgetc(fid);
		if(c == '\n'){
			i = i+1;
		}
	};

	//================================================================================80
	//	READ VALUES FROM THE FILE
	//================================================================================80

	fscanf(fid, "%d", &size[0]);

	fscanf(fid, "%d", &size_2[0]);

	//================================================================================80
	//	CLOSE FILE
	//================================================================================80

	fclose(fid);

}

//===============================================================================================================================================================================================================200
//	READ DATA FUNCTION
//===============================================================================================================================================================================================================200

void 
read_data(	char* filename,
			int size,
			int* input_a,
			int* input_b,
			int size_2,
			int* input_2a,
			int* input_2b){

	//================================================================================80
	//	VARIABLES
	//================================================================================80

	FILE* fid;
	int i;
	char c;

	//================================================================================80
	//	OPEN FILE FOR READING
	//================================================================================80

	fid = fopen(filename, "r");
	if( fid == NULL ){
		printf( "The file was not opened for reading\n" );
		return;
	}

	//================================================================================80
	//	SKIP LINES
	//================================================================================80

	i = 0;
	while(i<2){
		c = fgetc(fid);
		if(c == '\n'){
			i = i+1;
		}
	};

	//================================================================================80
	//	READ VALUES FROM THE FILE
	//================================================================================80

	for(i=0; i<size; i++){
		fscanf(fid, "%d", &input_a[i]);
	}
	for(i=0; i<size; i++){
		fscanf(fid, "%d", &input_b[i]);
	}

	for(i=0; i<size_2; i++){
		fscanf(fid, "%d", &input_2a[i]);
	}
	for(i=0; i<size_2; i++){
		fscanf(fid, "%d", &input_2b[i]);
	}

	//================================================================================80
	//	CLOSE FILE
	//================================================================================80

	fclose(fid);

}


//===============================================================================================================================================================================================================200
//	WRITE DATA FUNCTION
//===============================================================================================================================================================================================================200

void write_data(	char* filename,
			int frameNo,
			int frames_processed,
			int endoPoints,
			int* input_a,
			int* input_b,
			int epiPoints,
			int* input_2a,
			int* input_2b){

	//================================================================================80
	//	VARIABLES
	//================================================================================80

	FILE* fid;
	int i,j;
	char c;

	//================================================================================80
	//	OPEN FILE FOR READING
	//================================================================================80

	fid = fopen(filename, "w+");
	if( fid == NULL ){
		printf( "The file was not opened for writing\n" );
		return;
	}


	//================================================================================80
	//	WRITE VALUES TO THE FILE
	//================================================================================80
      fprintf(fid, "Total AVI Frames: %d\n", frameNo);	
      fprintf(fid, "Frames Processed: %d\n", frames_processed);	
      fprintf(fid, "endoPoints: %d\n", endoPoints);
      fprintf(fid, "epiPoints: %d", epiPoints);
	for(j=0; j<frames_processed;j++)
	  {
	    fprintf(fid, "\n---Frame %d---",j);
	    fprintf(fid, "\n--endo--\n",j);
	    for(i=0; i<endoPoints; i++){
	      fprintf(fid, "%d\t", input_a[j+i*frameNo]);
	    }
	    fprintf(fid, "\n");
	    for(i=0; i<endoPoints; i++){
	      // if(input_b[j*size+i] > 2000) input_b[j*size+i]=0;
	      fprintf(fid, "%d\t", input_b[j+i*frameNo]);
	    }
	    fprintf(fid, "\n--epi--\n",j);
	    for(i=0; i<epiPoints; i++){
	      //if(input_2a[j*size_2+i] > 2000) input_2a[j*size_2+i]=0;
	      fprintf(fid, "%d\t", input_2a[j+i*frameNo]);
	    }
	    fprintf(fid, "\n");
	    for(i=0; i<epiPoints; i++){
	      //if(input_2b[j*size_2+i] > 2000) input_2b[j*size_2+i]=0;
	      fprintf(fid, "%d\t", input_2b[j+i*frameNo]);
	    }
	  }
	// 	================================================================================80
	//		CLOSE FILE
		  //	================================================================================80

	fclose(fid);

}



//===============================================================================================================================================================================================================200
//	End
//===============================================================================================================================================================================================================200